Орхидея высотой 15—30 см с длинным ползучим корневищем. Листья эллиптические, заостренные, 6—12 см длиной, снизу по жилкам немного волосистые. Наружный верхний листочек околоцветника эллиптически-яйцевидный, заостренный, 1,8—2,8 см длиной, белый или с фиолетово-розовыми пятнами, нижний листочек, сросшийся из двух, зеленоватый, железисто-опушенный, 1,2—1,7 см длиной. Боковые листочки околоцветника голые, как и губа, белые, с крупными фиолетово-розовыми крапинами. Размножается в основном вегетативно.
Произрастает в хвойных, смешанных и лиственных лесах северо-востока европейской части России, в Западной и Восточной Сибири и на Дальнем Востоке.
Численность башмачка крапчатого повсеместно сокращается.